😫 做WB你是不是也这样崩溃过?
“Marker齐整、内参漂亮,目标条带却「若隐若现」。”
“上样量加到50μg,目标条带还是没变粗,背景却糊成雾。“
“抗体浓度翻倍,信号没涨,杂带先开花。”
遇到这样的情况,大概率目标蛋白是“低丰度”蛋白。
低丰度蛋白(Low-Abundance Protein, LAP)——只占细胞总蛋白的0.1%~3%,却是疾病标志物、药靶、磷酸化、泛素化、乙酰化事件的“主咖”。
例如:肿瘤早筛标志物(如IL-37、GDF-15),信号通路关键节点(如p-STAT3、NF-κB、p52),药物靶点(如SGLT1、Claudin-18.2)等。
问题根源
|
现象
|
传统做法
|
副作用
|
提取不全
|
RIPA沉淀里还有30%蛋白
|
加大裂解液
|
稀释信号
|
未富集亚细胞结构
|
检测核蛋白用全细胞裂解液
|
增加曝光时间
|
条带不可见
|
抗体亲和力低
|
0.5μg一抗看不见
|
加到2μg
|
杂带满天飞
|
被高丰度蛋白掩盖
|
白蛋白/Rubisco占80%
|
上样更多
|
背景爆炸
|
我们将10 年LAP实战经验浓缩成4个方案,让信号迅速提升,背景降一半。
不挑仪器,不挑样本,今天就能用——
① 「增溶」:让蛋白从沉淀里「走出来」
痛点
RIPA 裂解液是蛋白提取的常用试剂,却拿膜蛋白、核蛋白等难溶蛋白没办法——30% 以上蛋白跟着「白色沉淀」被扔掉。
Fig1.RIPA不同强度裂解液均产生不可溶性组分(白色沉淀)
方案
柱式法总蛋白提取试剂盒
-
特制裂解液配方 + 离心管柱技术
-
提高蛋白得率同步去除核酸及杂质,条带更锐
-
兼容下游WB、IP、Co-IP、质谱检测
Fig2.柱式法总蛋白提取和RIPA裂解液提取效果比较
实测数据(中科院健康所)
自配裂解液,RIPA裂解液,Invent柱式法蛋白提取试剂盒 × GIST肿瘤细胞
Fig3.不同蛋白提取方法检测结果比较
KDM5A(组蛋白赖氨酸去甲基化酶5A),在正常细胞中,KDM5A表达水平通常较低。但在多种癌症中呈现异常高表达,如肠癌、黑色素瘤等模型中,是检测肿瘤发生发展密切相关指标。H3K4me3是组蛋白,位于细胞核内,KDM5A通过调控H3K4me2/3去甲基化参与基因转录抑制。常规裂解液对KDM5A和H3K4me3的提取效率较低,检出的条带若隐若现,使用Invent柱式法总蛋白提取试剂盒(Cat#SD-001/SN-002),内参GAPDH统一,两个目标蛋白信号提升多倍,说明柱式法总蛋白提取方法可有效增溶目标蛋白。
② 「富集」:把目标细胞器「搬出来」单独跑
痛点
总蛋白里LAP占比过低,被高丰度蛋白「淹没」,上样50μg仍然检测不到。
方案
当目标蛋白在总蛋白中占比过低时,可根据目标蛋白的定位,进行亚细胞结构富集,从而增加检出效率。
Invent柱式法亚细胞结构分离系列工具(可分离质膜/核/线粒体/内质网/高尔基/溶酶体/内体/叶绿体等重要亚细胞结构)
实测数据(东京慈恵会医科大学)
Invent柱式法亚细胞结构分离试剂盒 ×灌注小鼠心脏
Fig5.质膜富集后目标蛋白信号明显提升
跨膜蛋白 SGLT1(~75 kDa),Na+/K+ ATPase(~113 kDa)属于难溶且低表达的膜蛋白,使用总蛋白样品或总膜蛋白检测SGLT1和Na+/K+ ATPase条带隐约不可见,使用Invent 动物质膜/蛋白和细胞组分分离试剂盒(Cat SM-005)将质膜组分富集后检测,可见目标条带清晰,条带锐利,背景干净,信噪比高。说明使用Invent柱式法亚细胞结构分离工具,可以有效富集亚细胞结构,提升目标检测信号强度。
③ 加「增强剂」:让抗体「多抓 3 倍蛋白」
痛点
抗体加量 → 背景先爆,信号仍弱。
方案
使用抗体增强剂(Antibody Enhancer)
实测数据
Fig6.使用脱脂奶粉和抗体增强剂稀释抗体检测结果对比小鼠肝脏提取总蛋白分别上样20ug,10ug,5ug,分别使用脱脂奶粉和Invent抗体增强剂(Cat WA-002)稀释抗体后,检测GAPDH条带。与脱脂奶粉相比,使用抗体增强剂后GAPDH信号强度大幅提升,特别是5ug样品条带从无到有,清晰可见。说明Invent抗体增强剂,可有效增加信号强度。
④ 「去高丰度」:把「噪音」直接踢掉
痛点
血清血浆中白蛋白、植物中Rubisco占总量 50–80%,遮蔽 LAP。
方案
高丰度蛋白去除剂
-
白蛋白去除率 > 95%
-
Rubisco 去除率 > 85%
-
兼容质谱/WB检测
实测数据
血清和血浆样品使用Invent白蛋白去除试剂(Cat WA-013)去除白蛋白后,低丰度蛋白条带检测明显富集(条带2)
Fig7.使用白蛋白去除剂后SDS-PAGE中条带变化
植物样品使用Invent植物Rubisco去除试剂盒(Cat RD-046)去除Rubisco,低丰度蛋白条带检测明显富集(条带2,3,5,6,7,9)。
Fig8.使用Rubisco去除剂后SDS-PAGE中条带变化
遇到目标条带若隐若现,不要慌,增溶 → 富集 → 增强 → 去高4 招可叠加,也可单用,平均节省 60% 抗体、50% 时间,信号提升 5–50 倍。